次の手順でエラーを解消する。 アプリケーションのEclipse.app/MacOS/Contents/MacOS に移動 ./eclipse -clean を実行して起動する。1回だけ。あとは通常どおりでOK。

いろいろ揉めてるので、参考になる記事をぶっくま。 SQLの論理形式 - ミックのブログ ＳＱＬの魔術: Javaの日々